Podle Mezinárodních zdravotnických předpisů se očkovací průkaz proti žluté zimnici vyžaduje u všech cestujících od devíti měsíců věku. Certifikát platí doživotně, přeočkování nikdo požadovat nesmí.
Kromě běžného očkovacího kalendáře se většině cestujících doporučuje očkování proti hepatitidě A, břišnímu tyfu a žluté zimnici. Podle oblasti, délky pobytu a toho, co budete dělat, se zvažuje i očkování proti chikungunye, choleře, hepatitidě B, meningokokům a vzteklině.
Malárie hrozí na celém území a CDC doporučuje antimalarickou profylaxi.
Voda z vodovodu je pitná až po převaření. Převařit je nutné i mléko — místní není pasterizované.
Vážné úrazy umí ošetřit tři nemocnice v Bujumbuře — Kira Hospital, vojenská nemocnice v Kamenge a Lékaři bez hranic v nemocnici Prince Régent Charles. Mimo hlavní město odpovídající zařízení chybějí a může být nutný převoz do Keni nebo Rwandy.