Hurikánová sezóna trvá od června do konce listopadu s vrcholem v září, přináší riziko silného větru, přívalových dešťů a záplav. Země leží na hranici karibské a severoamerické tektonické desky, zemětřesení jsou proto možná (zhruba jednou ročně citelnější otřes), typicky ale ne extrémní intenzity. V horských oblastech hrozí po vydatných deštích sesuvy půdy.
Na plážích Juan Dolio a Boca Chica se snadno šlápne na mořského ježka, jehož bodliny způsobují silnou bolest a riziko infekce. V přírodě žijí štíři (uštknutí nebezpečné hlavně pro alergiky) a jedovatý had žararaka, jehož uštknutí u člověka není smrtelné, ale vyžaduje ošetření. V jezeře Enriquillo na jihozápadě země žijí i američtí krokodýli, s běžnou turistikou u pobřeží se ale nepotkávají.
Nejvyšší horou je Pico Duarte (3 098 m, nejvyšší vrchol Karibiku), výstup na něj trvá typicky 2–3 dny s postupným stoupáním. Výšková nemoc je díky pozvolnému výstupu vzácná, přesto se doporučuje dostatek odpočinku a hydratace.