MZV ČR popisuje Gabon jako zemi s rozšířenou pouliční kriminalitou a korupcí a s vysokým výskytem HIV/AIDS. Fotografovat vládní a vojenské objekty je přísně zakázané. MZV doporučuje ověřit si aktuální bezpečnostní situaci před cestou a zaregistrovat se v systému DROZD.
Odlehlá místa po setmění a tiché pláže v okolí Libreville — britské ministerstvo zahraničí tam eviduje loupeže, ozbrojené přepadení i znásilnění. V Libreville dochází ke krádežím v taxi a ke krádežím vozidel. Mimo města jsou silnice ve špatném stavu a v období dešťů (říjen–prosinec a únor–květen) sjízdné jen terénním vozem. V noci se mimo město nejezdí, silnice nejsou osvětlené.
Nejčastější je zneužití platební karty — mimo velké hotelové řetězce je podvod s kartami běžný. Karta se stejně skoro nikde jinde nepoužije, takže nejbezpečnější je platit hotově a z bankomatu vybírat jen na hlídaných místech.
Vysoká vlhkost a srážky během období dešťů (březen–květen, září–prosinec). Cyklóny se sem obvykle nedostanou. Ovšem záplavy mohou postihnout některé oblasti.
FCDO uvádí mezi hlášenými trestnými činy i znásilnění. Doporučuje nechodit do odlehlých míst po setmění, vyhnout se opuštěným plážím u Libreville a jezdit výhradně licencovanými taxíky. Cennosti nenoste na očích; při přepadení je radou věci vydat.
Gabon stejnopohlavní styk v roce 2019 kriminalizoval a v červenci 2020 zákaz opět zrušil. Svazky párů stejného pohlaví stát neuznává, ústava z roku 2024 definuje manželství jako svazek muže a ženy a ochrana před diskriminací chybí.
V Gabonu velvyslanectví není. Konzulární působnost má velvyslanectví ČR v Abuji: tel. +234 703 757 1096, Abuja.Consulate@mzv.gov.cz. Přímo v Libreville je honorární konzulát (Nzeng-Ayong, první odbočka vpravo za čerpací stanicí OiLibya, B.P. 8703, tel. +241 040 614 37, Libreville.Honorary@mzv.gov.cz) — návštěvu je nutné domluvit předem telefonicky. Nouzová linka MZV: +420 222 420 222.