Certifikát chtějí jen po cestujících od 1 roku, kteří přijíždějí ze země s rizikem žluté zimnice — počítá se i přestup delší než 12 hodin. Při přímé cestě z Česka nebo s přestupem v Evropě se nevyžaduje.
Kromě běžného očkovacího kalendáře (tetanus, spalničky) se doporučuje hepatitida A a břišní tyfus. Očkování proti žluté zimnici se v Guatemale neplatí povinně (země není v endemické oblasti), ale bývá doporučováno cestovatelům mířícím i do jiných rizikových zemí regionu. Vzteklina se doporučuje při delším pobytu nebo kontaktu se zvířaty.
Malárie se přenáší hlavně v departementech Alta Verapaz, Baja Verapaz, Escuintla, Izabal a Petén, pro které CDC doporučuje antimalarickou profylaxi; jinde jde o ojedinělé případy. Guatemala City, Antigua ani jezero Atitlán riziko nemají. Vyskytuje se i dengue.
Soukromé nemocnice ve velkých městech (Guatemala City, Antigua) poskytují kvalitní péči srovnatelnou se západním standardem, ale je nutné za ni platit předem v hotovosti nebo kartou. Veřejné zdravotnictví a péče na venkově je výrazně slabší a hůře vybavená.
Krátká návštěva soukromého lékaře (15 min) v Guatemala City, 2026.
Podobně jako v jiných zemích regionu je dovoz léků s obsahem kodeinu a dalších silnějších opioidů, psychofarmak a stimulancií bez lékařského potvrzení problematický a kontroluje se na hranicích. Doporučuje se vozit léky v originálním balení s příbalovým letákem a mít u sebe lékařské potvrzení/recept, zvlášť u léků na předpis.
Nejvyšší bod je sopka Tajumulco (4220 m), nejvyšší vrchol Střední Ameriky. Výšková nemoc hrozí hlavně při výstupu na sopky Acatenango (3976 m) nebo Tajumulco s nocováním na táboře — doporučuje se pomalé tempo a aklimatizace. Města jako Antigua (~1500 m) nebo jezero Atitlán (~1560 m) výškovou nemoc běžně nezpůsobují, citlivější jedinci mohou pociťovat mírnou únavu nebo bolest hlavy první den.