Nejlépe se jede na jaře nebo na podzim. Jaro je teplé, ale ne horké, s málo deštěm, v březnu a dubnu kvetou sakury. Léto začíná v červnu obdobím dešťů cuju a v červenci a srpnu je dusno s teplotami až k 40 °C. Podzim od září přináší snesitelné teploty a barevné listí, na začátku ale jih zasahují tajfuny. Zima se hodí na lyže a onseny, na Hokkaidó a severovýchodě hodně sněží.
V Tokiu naprší za rok kolem 1 600 mm, víc v létě než v zimě. Od června do srpna 155–170 mm za měsíc, nejvíc v září a říjnu (225–235 mm), nejsušší je prosinec až únor s necelými 60 mm (normál 1991–2020). Tajfuny Tokio zasahují skoro každý rok.