Většině cestujících stačí běžný očkovací kalendář a přeočkování proti tetanu, pokud od poslední dávky uplynulo přes 10 let. Podle oblasti, délky pobytu a toho, co budete dělat, se zvažuje i očkování proti hepatitidě B, japonské encefalitidě (pobyt nad měsíc od června do října nebo u rýžových polí), klíšťové encefalitidě, vzteklině a horečce dengue.
Japonsko není v EU, EHIC tu neplatí. Léčba je drahá, a kdo ji nezaplatí, toho Japonsko příště nemusí pustit do země. Cestovní pojištění jde koupit i po příletu.
Japonsko je pro běžné turisty bez rizika malárie i dengue. Ojediněle se vyskytnou lokální přenosy dengue po zavlečení nakaženým komárem (např. Tokio 2014), jde ale o výjimečné případy, ne endemické riziko.
Hygienické standardy v přípravě jídla i v konbini jsou v Japonsku velmi vysoké, včetně syrových ryb (sushi/sašimi) z prověřených zdrojů.
Zdravotnictví má vysokou úroveň, léčba je ale drahá a platí se celá. Nemocnice může nejdřív ověřovat pojištění, což ošetření zdrží.
Orientační cena běžné pohotovostní konzultace v soukromé nemocnici bez pojištění, 2026 — k tomu se připočítávají vyšetření (rentgen, krevní testy, CT), celková částka rychle roste.
Léky s amfetaminem (Adderall, Dexedrin) do Japonska nepřivezeš ani s předpisem, dovoz je zakázaný. Lisdexamfetamin (Elvanse, Vyvanse), léky s víc než 10 % pseudoefedrinu a opioidy jako morfin, oxykodon nebo kodein (nad 1 %) smíš přivézt jen s povolením, o které se žádá předem u japonského ministerstva zdravotnictví.