Certifikát chtějí při vstupu po všech cestujících od 9 měsíců. Kdo zůstane 4 týdny a déle, může při odjezdu potřebovat i doklad o očkování proti dětské obrně, podaném 4 týdny až 12 měsíců před odjezdem.
Kromě běžného očkovacího kalendáře se většině cestujících doporučuje očkování proti hepatitidě A, břišnímu tyfu a žluté zimnici. Podle oblasti, délky pobytu a toho, co budete dělat, se zvažuje i očkování proti chikungunye, choleře, hepatitidě B, meningokokům a vzteklině.
EHIC v Jižním Súdánu neplatí. Zdravotnická infrastruktura je nedostatečná, vážnější případy vyžadují leteckou evakuaci. Konzulární pomoc přes Velvyslanectví ČR v Addis Abebě je omezena na telefonickou konzultaci v nouzi.
Vysoké riziko malárie (převážně P. falciparum) po celé zemi celoročně, antimalarická profylaxe se doporučuje všem cestovatelům.
CDC tu za posledních deset let nemá doklad o místním přenosu dengue.