Certifikát chtějí jen po cestujících od 1 roku, kteří přijíždějí ze země s rizikem žluté zimnice — počítá se i přestup delší než 12 hodin. Při přímé cestě z Česka nebo s přestupem v Evropě se nevyžaduje.
Základní očkování dle kalendáře, doporučena hepatitida A a břišní tyfus. Kvůli vzestupu malárie v roce 2026 je nutná i antimalarická profylaxe.
Mayotte je jako francouzský DROM součástí EHS a evropský průkaz zdravotního pojištění zde platí. Kapacita zdejší nemocnice je po cyklonu Chido (prosinec 2024) stále omezená, vážnější případy se řeší převozem do Réunionu nebo metropolitní Francie.
Malárie byla na Mayotte dlouho pod kontrolou, CDC ale znovu hlásí přibývající případy nákazy přímo na ostrově a doporučuje antimalarickou profylaxi.
CDC řadí zemi do nejvyššího stupně rizika dengue: místní případy se tu objevují často nebo nepřetržitě. Komáři, kteří ji přenášejí, žijí hlavně pod 2 000 m n. m., výš je riziko velmi nízké.
Mayotte čelí od roku 2023 vodní krizi — sucho a dlouhodobě podfinancovaná vodárenská síť vedou k přerušovaným dodávkám (voda teče často jen jeden den ze tří) a zdravotní úřad opakovaně eviduje nevyhovující vzorky. Doporučuje se výhradně balená voda, a to i pro mytí ovoce a zeleniny.
Jediná velká nemocnice (CHM Mamoudzou) přišla při cyklonu Chido o 40 % lůžek a v roce 2025 fungovala na omezenou kapacitu, vážnější případy se řeší převozem na Réunion nebo do metropolitní Francie.