Nejpříjemnější je paraguayská zima od května do září — je to nejsušší období s mírnými teplotami. Léto (prosinec–únor) bývá extrémně horké, teploty přes den běžně přesahují 35 °C, a je zároveň nejdeštivější, cestování mimo velká města proto komplikuje i vlhko a záplavy.
Východní Paraguay má srážky rozložené během celého roku, výrazně vydatnější jsou ale letní měsíce od října do dubna s vrcholem v listopadu. Nejsušší je srpen. Chaco na severozápadě je oproti tomu polosuchý s podstatně nižšími srážkami.