Certifikát o očkování proti žluté zimnici Salvador od května 2024 nevyžaduje.
Kromě běžného očkovacího kalendáře se většině cestujících doporučuje očkování proti hepatitidě A a břišnímu tyfu. Podle oblasti, délky pobytu a toho, co budete dělat, se zvažuje i očkování proti chikungunye a vzteklině.
CDC u této destinace malárii neuvádí, antimalarika proto nejsou potřeba. Vyskytuje se ale dengue, kterou přenášejí komáři aktivní hlavně přes den.
NaTHNaC řadí u Salvadoru žloutenku typu A i břišní tyfus mezi očkování doporučená většině cestovatelů — obojí se přenáší kontaminovaným jídlem a vodou. Choleru u země neuvádí. Pít proto balenou, převařenou nebo filtrovanou vodu, včetně vody na led.