V horských oblastech (Vysoké a Nízke Tatry) hrozí v zimě laviny a náhlé změny počasí, na jaře při tání sněhu bleskové povodně v horských údolích. Jinak je země z pohledu přírodních rizik klidná.
Skutečné riziko představují hlavně klíšťata (přenašeči klíšťové encefalitidy a boreliózy) v lesích a na loukách od jara do podzimu. Ve Vysokých a Nízkych Tatrách žijí medvědi hnědí — setkání jsou vzácná, ale doporučuje se dodržovat zásady bezpečného chování v jejich území.
Nejvyšší hora Slovenska, Gerlachovský štít ve Vysokých Tatrách, měří 2 655 m — mírně nad hranicí, od které se může objevit výšková nemoc. Většina turistických tras ale zůstává pod 2 000 m, riziko je tak relevantní jen pro vysokohorské výstupy.