Základní očkování dle kalendáře, dále hepatitida A a B, břišní tyfus, meningokok a vzteklina.
EHIC v Somálsku neplatí, zdravotnická infrastruktura je zcela nedostatečná a jakýkoli vážnější zásah vyžaduje leteckou evakuaci.
Malárie (převážně P. falciparum, rezistentní na chlorochin) hrozí celoročně po celé zemi, nižší a sezónní riziko je na severu, vyšší ve středních a jižních oblastech.
CDC řadí zemi do nejvyššího stupně rizika dengue: místní případy se tu objevují často nebo nepřetržitě. Komáři, kteří ji přenášejí, žijí hlavně pod 2 000 m n. m., výš je riziko velmi nízké.
Zdravotnická infrastruktura je po desetiletích konfliktu zcela nedostatečná i v hlavním městě.
Žvýkání rostliny khat (kata) je v Somálsku legální a společensky rozšířené, v EU včetně ČR je ale kat řazen mezi omamné látky a jeho dovoz/vývoz je nelegální.