Základní očkování dle kalendáře, doporučeny hepatitida A a B, břišní tyfus. Vzhledem ke špatné zdravotnické infrastruktuře MZV doporučuje mít aktuální očkování v pořádku ještě před cestou.
EHIC v Tádžikistánu neplatí. MZV doporučuje kvalitní pojištění zahrnující evakuaci helikoptérou — ta z oblasti Pamíru může stát přes 20 000 USD.
WHO certifikovala Tádžikistán v roce 2023 jako zemi bez malárie.
CDC tu za posledních deset let nemá doklad o místním přenosu dengue.
NaTHNaC řadí u Tádžikistánu žloutenku typu A mezi očkování doporučená všem dosud neočkovaným a břišní tyfus přidává těm, kdo pojedou do oblastí, kde je sanitace a hygiena jídla pravděpodobně špatná. Pít proto balenou nebo převařenou vodu, i v Dušanbe. Ve výškách Pamíru navíc voda vře při nižší teplotě, takže krátké převaření nemusí stačit.
MZV přímo uvádí špatnou zdravotnickou infrastrukturu jako jedno z hlavních rizik cesty. Soukromé kliniky v Dušanbe nabízí o něco lepší péči, mimo hlavní město je dostupnost minimální.
Orientační cena běžné konzultace v soukromé klinice v Dušanbe, 2026. Nemocnice v Tádžikistánu obvykle vyžadují platbu hotově předem bez ohledu na cestovní pojištění.
Drogy jsou nelegální, za držení, distribuci i přepravu hrozí mnohaleté tresty vězení ve velmi tvrdých podmínkách — MZV na to výslovně upozorňuje kvůli blízkosti Afghánistánu a tranzitu narkotik přes území země.
Dušanbe leží nízko (706 m) bez rizika, ale Pamirská magistrála na východě země stoupá na náhorní plošinu 3500–4500 m (nejvyšší průsmyk Ak-Baital 4655 m) a výšková nemoc je tam reálné riziko i pro běžné turisty bez horolezeckých ambic.